Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms