Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT1P21579 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT1P21579 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.6 ms