Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD247P20963 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CD247P20963 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CD247P20963 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CD247P20963 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CD247P20963 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD247P20963 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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