Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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