Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.8 ms