Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms