Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms