Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms