Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP13Q92995 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms