Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms