Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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