Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms