Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms