Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms