Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PROK1P58294 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PROK1P58294 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PROK1P58294 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PROK1P58294 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
PROK1P58294 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PROK1P58294 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms