Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NESP48681 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NESP48681 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NESP48681 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NESP48681 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NESP48681 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NESP48681 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms