Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCC3P46736 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCC3P46736 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms