Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BRAFP15056 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BRAFP15056 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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