Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms