Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms