Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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