Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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