Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms