Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms