Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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