Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms