Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL3P58872 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 656.1 ms