Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms