Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF9P41273 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms