Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms