Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFC1P35251 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFC1P35251 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFC1P35251 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFC1P35251 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFC1P35251 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFC1P35251 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RFC1P35251 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms