Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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