Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC175P0C221 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC175P0C221 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms