Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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