Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms