Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KNCNA6PVL3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms