Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms