Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRMT13Q9NUP7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRMT13Q9NUP7 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRMT13Q9NUP7 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRMT13Q9NUP7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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