Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FANCFQ9NPI8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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