Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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