Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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