Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms