Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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