Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms