Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms