Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms