Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CFTRP13569 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFTRP13569 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms