Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GLI3P10071 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GLI3P10071 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms