Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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