Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms